Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Exo5Q9CXP9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Exo5Q9CXP9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms