Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CXL3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms