Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sgo1Q9CXH7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Sgo1Q9CXH7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms