Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed5Q9CXE7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms