Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Xrcc3Q9CXE6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms