Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Psmd8Q9CX56 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Psmd8Q9CX56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms