Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RpainQ9CWY9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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RpainQ9CWY9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RpainQ9CWY9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RpainQ9CWY9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RpainQ9CWY9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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