Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxxc1Q9CWW7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms