Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tdrd12Q9CWU0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms