Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smurf1Q9CUN6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smurf1Q9CUN6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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