Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smc1aQ9CU62 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smc1aQ9CU62 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms