Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms