Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fcf1Q9CTH6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fcf1Q9CTH6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms