Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Sft2d3Q9CSV6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sft2d3Q9CSV6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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