Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rprd1bQ9CSU0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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