Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Snw1Q9CSN1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snw1Q9CSN1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms