Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms