Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4931417E11RikQ9CR05 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms