Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmd9Q9CR00 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Psmd9Q9CR00 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms