Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mrpl35Q9CQL6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Mrpl35Q9CQL6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms