Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nipsnap3bQ9CQE1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms