Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ubl4bQ9CQ84 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ubl4bQ9CQ84 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ubl4bQ9CQ84 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms