Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
1700129C05RikQ9CQ77 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms