Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpa3Q9CQ71 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpa3Q9CQ71 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms