Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Use1Q9CQ56 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Use1Q9CQ56 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Use1Q9CQ56 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms