Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Chmp3Q9CQ10 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms