Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CPS8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms