Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nsmce3Q9CPR8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce3Q9CPR8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms