Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Krt88Q9CPR6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt88Q9CPR6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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