Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scd3Q99PL7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scd3Q99PL7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms