Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcgf6Q99NA9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcgf6Q99NA9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms