Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brms1Q99N20 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Brms1Q99N20 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms