Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gins4Q99LZ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gins4Q99LZ3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms