Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cstf3Q99LI7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cstf3Q99LI7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms