Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp16Q99LG0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp16Q99LG0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms