Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Abcf2Q99LE6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Abcf2Q99LE6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms