Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gps1Q99LD4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gps1Q99LD4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms