Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TriobpQ99KW3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TriobpQ99KW3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms