Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prpf19Q99KP6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf19Q99KP6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms