Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TrabdQ99JY4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TrabdQ99JY4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms