Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Klhl22Q99JN2 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Klhl22Q99JN2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms