Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Cldn16Q925N4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cldn16Q925N4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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