Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Csmd1Q923L3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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