Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Spdl1Q923A2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Spdl1Q923A2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms