Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim59Q922Y2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim59Q922Y2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms