Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tubb6Q922F4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms