Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms