Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde6cQ91ZQ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Pde6cQ91ZQ1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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