Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrc49Q91YK0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms