Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms